Prevalence and Molecular Characterization of Salmonella Isolated from Broiler Farms at the Tolima Region-Colombia.

Salmonella is an important animal and human pathogen responsible for Salmonellosis, and it is frequently associated with the consumption of contaminated poultry products. The aim of this study was to estimate the prevalence of Salmonella in the poultry farms and to determine the genetic relationship. A total of 135 samples collected from fifteen broiler farms, including cloacal, feed, water, environmental and farm operator faeces samples were subjected to microbiological isolation. Molecular confirmation of Salmonella isolates was carried out by amplification of the invA gene, discrimination of d-tartrate-fermenting Salmonella isolates using multiplex PCR, and subsequently analysed by pulsed-field gel electrophoresis (PFGE). A survey questionnaire was conducted to identify potential risk factors for Salmonella presence in broiler farms. The prevalence of Salmonella at the farm level was 26.67%, and Salmonella isolates were serotyped as S. Paratyphi B and all isolates were d-tartrate-fermenting (dT+). PFGE showed three highly similar clusters and one significantly different Salmonella isolate. S. Paratyphi B continued to be present in different links of the poultry chain in the Tolima region, and identification of its main source is necessary to control its dissemination.

A common Salmonella Enteritidis sequence type from poultry and human gastroenteritis in Ibagué, Colombia / Un tipo de secuencia común de Salmonella Enteritidis de origen aviar y de humano con gastroenteritis en Ibagué, Colombia

Salmonella Enteritidis es una de las mayores causas de salmonelosis en el mundo, siendo los huevos contaminados y la carne de pollo cruda sus principales fuentes de infección. En Ibagué, Colombia, se identificaron los principales serovares circulando en granjas, superficies de huevos y canales de pollo, sin embargo, se desconoce si esos serovares son responsables de gastroenteritis. Objetivo. Evaluar la relación genética entre aislamientos de Salmonella Enteritidis de aves de corral y humanos con gastroenteritis mediante multilocus sequence typing (MLST). Materiales y métodos. Se aisló Salmonella spp., de casos clínicos de gastroenteritis (n=110). Se realizó test de sensibilidad antibiótica, seguido de serotipificación y tipificación por medio de MLST y se comparó S. Enteritidis de humanos frente a S. Enteritidis de granjas ponedoras y de huevo comercializado (n=6). Resultados. Se aislaron 10 cepas de Salmonella spp., a partir de heces de humanos con gastroenteritis. Se obtuvo una prevalencia de Salmonella spp. de 9.09%, siendo S. Enteritidis (n=4), S. Typhymurium (n=2), S. Newport (n=1), S. Grupensis (n=1), S. Uganda (n=1) y S. Braenderup (n=1) los serotipos presentes en pacientes con gastroenteritis. El MLST indico que un tipo de secuencia común (ST11) de S. Enteritidis estuvo presente en todas las tres fuentes y mostraron el mismo patrón de resistencia antibiótica. Conclusión. S. Enteritidis ST11 constituye un vínculo entre el consumo/manipulación de huevos contaminados y gastroenteritis humana en Ibagué. Son necesarios estudios complementarios para conocer si otros serovares de Salmonella aislados de carne de pollo cruda también se asocian con la gastroenteritis humana.

Introducción. Salmonella Enteritidis es una de las mayores causas de salmonelosis en el mundo, siendo los huevos contaminados y la carne de pollo cruda sus principales fuentes de infección. En Ibagué, Colombia, se identificaron los principales serovares circulando en granjas, superficies de huevos y canales de pollo, sin embargo, se desconoce si esos serovares son responsables de gastroenteritis. Objetivo. Evaluar la relación genética entre aislamientos de Salmonella Enteritidis de aves de corral y humanos con gastroenteritis mediante multilocus sequence typing (MLST). Materiales y métodos. Se aisló Salmonella spp., de casos clínicos de gastroenteritis (n=110). Se realizó test de sensibilidad antibiótica, seguido de serotipificación y tipificación por medio de MLST y se comparó S. Enteritidis de humanos frente a S. Enteritidis de granjas ponedoras y de huevo comercializado (n=6). Resultados. Se aislaron 10 cepas de Salmonella spp., a partir de heces de humanos con gastroenteritis. Se obtuvo una prevalencia de Salmonella spp. de 9.09%, siendo S. Enteritidis (n=4), S. Typhymurium (n=2), S. Newport (n=1), S. Grupensis (n=1), S. Uganda (n=1) y S. Braenderup (n=1) los serotipos presentes en pacientes con gastroenteritis. El MLST indico que un tipo de secuencia común (ST11) de S. Enteritidis estuvo presente en todas las tres fuentes y mostraron el mismo patrón de resistencia antibiótica. Conclusión. S. Enteritidis ST11 constituye un vínculo entre el consumo/manipulación de huevos contaminados y gastroenteritis humana en Ibagué. Son necesarios estudios complementarios para conocer si otros serovares de Salmonella aislados de carne de pollo cruda también se asocian con la gastroenteritis humana.

A common Salmonella Enteritidis sequence type from poultry and human gastroenteritis in Ibagué, Colombia / Un tipo de secuencia común de Salmonella Enteritidis de origen aviar y de humano con gastroenteritis en Ibagué, Colombia

Abstract Introduction: Salmonella Enteritidis is a major cause of human salmonellosis in the world, with contaminated eggs and raw chicken meat as the main routes of infection. The main Salmonella spp. serovars circulating in laying hen farms, the surface of eggs, and in raw chicken carcasses have been identified in Ibagué, Colombia. However, it is unknown whether those serovars are responsible for human gastroenteritis. Objective: To evaluate the genetic relationship between gastroenteritis and Salmonella Enteritidis isolates from poultry and humans using multilocus sequence typing (MLST). Materials and methods: Salmonella spp. was isolated from clinical cases of gastroenteritis (n=110). Antibiotic susceptibility tests, followed by serotyping and MLST were conducted and S. Enteritidis was compared to those from laying hen farms and marketed eggs. Results: Ten isolates of Salmonella spp. were obtained from the stools of people with gastroenteritis. The prevalence of Salmonella spp. in human stools was 9.09%, and S. Enteritidis (n=4), S. Typhymurium (n=2), S. Newport (n=1), S. Uganda (n=1), S. Grupensis (n=1), and S. Braenderup (n=1) were the main serotypes. MLST indicated that a common S. Enteritidis sequence type (ST11) was present in all three sources and showed the same antibiotic resistance pattern. Conclusion: Salmonella Enteritidis ST11 constitutes a link between consumption and manipulation of contaminated eggs and human gastroenteritis in Ibagué. Additional studies would be required to establish if other Salmonella serovars isolated from raw chicken meat are also associated with human gastroenteritis.

Resumen Introducción. Salmonella Enteritidis es una de las mayores causas de salmonelosis en el mundo; los huevos contaminados y la carne de pollo cruda son sus principales fuentes de infección. En Ibagué, Colombia, se han identificado los principales serovares que circulan en granjas, superficies de huevos y canales de pollo, pero se desconoce si esos serovares son responsables de la gastroenteritis. Objetivo. Evaluar la relación genética entre los aislamientos de Salmonella Enteritidis de aves de corral y de humanos con la gastroenteritis mediante tipificación de multiloci de secuencias (Multilocus Sequence Typing, MLST). Materiales y métodos. Se aisló Salmonella spp. de casos clínicos de gastroenteritis (n=110). Se hizo la prueba de sensibilidad antibiótica, así como la serotipificación y la tipificación mediante MLST, y se comparó S. Enteritidis de humanos con la hallada en granjas de gallinas ponedoras y en huevo comercializado (n=6). Resultados. Se aislaron 10 cepas de Salmonella spp. a partir de heces de humanos con gastroenteritis. Se obtuvo una prevalencia de Salmonella spp. de 9,09%, y se identificaron los serotipos S. Enteritidis (n=4), S. Typhymurium (n=2), S. Newport (n=1), S. Grupensis (n=1), S. Uganda (n=1) y S. Braenderup presentes en pacientes con gastroenteritis. Mediante la MLST, se comprobó que un tipo de secuencia común (ST11) de S. Enteritidis estuvo presente en todas las tres fuentes y presentó el mismo patrón de resistencia antibiótica. Conclusión. Salmonella Enteritidis ST11 constituye un vínculo entre el consumo y la manipulación de huevos contaminados, y la gastroenteritis en humanos en Ibagué. Se requieren estudios complementarios para conocer si otros serovares de Salmonella aislados de carne de pollo cruda también se asocian con la gastroenteritis en humanos.